134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1155 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 245 aa  477  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  97.29 
 
 		 222 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  81.04 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  79.44 
 
 		 215 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  79.44 
 
 		 215 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  79.17 
 
 		 217 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2042  phosphoribosyltransferase  75.45 
 
 		 222 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  60.77 
 
 		 232 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  59.72 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  59.72 
 
 		 235 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  59.72 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  55.35 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  51.85 
 
 		 679 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  51.85 
 
 		 679 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  51.85 
 
 		 845 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  49.27 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  47.47 
 
 		 682 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  50.7 
 
 		 681 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  41.9 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  53.17 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 214 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  47.32 
 
 		 681 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  50.49 
 
 		 681 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  51.71 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  42.11 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  43.2 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  42.11 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  45.07 
 
 		 224 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  43.2 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  48.13 
 
 		 352 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  45.63 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 		 459 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  51.92 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  51.44 
 
 		 418 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  47.91 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  51.22 
 
 		 669 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 		 227 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 210 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  46.4 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  49.75 
 
 		 439 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 		 477 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  48.79 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  44.13 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  46.63 
 
 		 443 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 		 441 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  49.76 
 
 		 668 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0716  phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  45.19 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  47.91 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_696  phosphoribosyl transferase domain protein  41.06 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0790  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  41.06 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.582964  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  47.32 
 
 		 446 aa  148  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  42.08 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  45.63 
 
 		 441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  44.66 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  44.29 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  45.07 
 
 		 885 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  45.07 
 
 		 885 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  42.92 
 
 		 884 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  43.9 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  42.66 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 211 aa  142  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  41.06 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  48.13 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  41.78 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 		 459 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 		 437 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  47.96 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 443 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>