137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0796 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  84.75 
 
 
223 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
207 aa  178  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  42.23 
 
 
214 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
223 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
223 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
208 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  41.31 
 
 
220 aa  157  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  38.21 
 
 
217 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  40.29 
 
 
214 aa  155  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
214 aa  155  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 
219 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
222 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  41.06 
 
 
222 aa  155  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 
226 aa  154  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  41.35 
 
 
224 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
222 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  40.98 
 
 
216 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 
216 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
208 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  41.35 
 
 
216 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  39.23 
 
 
221 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  43.48 
 
 
443 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  41.35 
 
 
216 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  41.47 
 
 
229 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 
441 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  39.34 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1594  phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  39.34 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  39.34 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  42.51 
 
 
418 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  39.07 
 
 
242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  40.3 
 
 
209 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
209 aa  144  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  38.57 
 
 
682 aa  144  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  39.61 
 
 
477 aa  144  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  38.39 
 
 
232 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 
235 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  40.19 
 
 
459 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  38.83 
 
 
352 aa  141  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  42.79 
 
 
669 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  39.71 
 
 
885 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  39.71 
 
 
885 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  41.63 
 
 
441 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  38.32 
 
 
681 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  40.87 
 
 
220 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  37.73 
 
 
229 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1814  phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
217 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.055799  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 
207 aa  138  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
468 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
208 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
224 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  42.72 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  37.38 
 
 
679 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  37.38 
 
 
679 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  37.38 
 
 
845 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  37.81 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  37.14 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  37.8 
 
 
884 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  37.91 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  37.91 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
234 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
439 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 
241 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 
223 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  37.98 
 
 
228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.86 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
446 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
214 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  41.12 
 
 
232 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
210 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
229 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  39.45 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
225 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
232 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  41.83 
 
 
668 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
215 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
215 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 
459 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  36.32 
 
 
681 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  37.02 
 
 
222 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
217 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
223 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1884  hypothetical protein  33.8 
 
 
430 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
222 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>