138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5866 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  80.53 
 
 		 229 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 222 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  47.79 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  48.89 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  47.96 
 
 		 885 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  47.96 
 
 		 885 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  50.66 
 
 		 884 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  51.36 
 
 		 209 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  49.34 
 
 		 477 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.49 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  40.09 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 		 220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  49.77 
 
 		 669 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  44.69 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  47.47 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 214 aa  161  9e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  39.73 
 
 		 218 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  44.8 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  45.13 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  39.73 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  47.79 
 
 		 235 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  44.89 
 
 		 682 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.79 
 
 		 235 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  40.28 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.35 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  44.95 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 		 459 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  40.28 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  48.68 
 
 		 668 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  44.14 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 		 219 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  42.01 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  42.6 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  46.79 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  46.37 
 
 		 459 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  43.89 
 
 		 441 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  46.58 
 
 		 443 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  44.25 
 
 		 418 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 		 437 aa  148  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 208 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  52.31 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  45.62 
 
 		 352 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  42.13 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  38.99 
 
 		 223 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  46.12 
 
 		 221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  39.45 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  42.79 
 
 		 441 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 207 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  42.42 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  41.48 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  43.06 
 
 		 845 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  43.6 
 
 		 679 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  43.6 
 
 		 679 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 446 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 		 223 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  43.44 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  45.65 
 
 		 443 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1594  phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 209 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  40.71 
 
 		 207 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 215 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 439 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 227 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 227 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 227 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  44.29 
 
 		 681 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  44.95 
 
 		 681 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  40.28 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  41.47 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2301  phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 		 215 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000143676 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 		 208 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  42.98 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5577  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 228 aa  131  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  42.27 
 
 		 681 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>