137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4714 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 222 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  57.41 
 
 		 242 aa  246  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 		 223 aa  234  6e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 		 226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  55.4 
 
 		 885 aa  207  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  55.4 
 
 		 885 aa  207  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  47.64 
 
 		 217 aa  205  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 		 221 aa  204  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  54.59 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  52.13 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  46.01 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  46.01 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  53.81 
 
 		 232 aa  194  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  54.29 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  51.69 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  51.72 
 
 		 884 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  50.23 
 
 		 441 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 		 224 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  50.69 
 
 		 682 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  44.02 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  49.77 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  43.54 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  49.77 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 214 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  48.36 
 
 		 228 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  49.53 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  55.71 
 
 		 260 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  49.06 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  51.42 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.17 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  49.05 
 
 		 477 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  49.05 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  49.05 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  49.05 
 
 		 235 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  47.87 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  47.87 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  50.48 
 
 		 669 aa  168  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  49.32 
 
 		 418 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  49.54 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  47.91 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0900  phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  47.89 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  51.69 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  47.62 
 
 		 441 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  44.76 
 
 		 459 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  46.41 
 
 		 679 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  46.41 
 
 		 679 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  45.71 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  46.41 
 
 		 845 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  50.48 
 
 		 459 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  46.76 
 
 		 352 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  47.64 
 
 		 443 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  51.98 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  48.58 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  49.55 
 
 		 245 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  45.07 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  45.07 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  49.29 
 
 		 437 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  46.86 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  45.91 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  44.84 
 
 		 681 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  50.24 
 
 		 668 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  48.36 
 
 		 443 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  44.61 
 
 		 681 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  45.85 
 
 		 439 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  45.59 
 
 		 681 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  50.25 
 
 		 446 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  37.67 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 		 214 aa  147  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  48.6 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>