182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6485 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
209 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  53.85 
 
 
228 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  53.37 
 
 
235 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  53.37 
 
 
235 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  45.02 
 
 
217 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  53.37 
 
 
235 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  52.17 
 
 
679 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  52.17 
 
 
679 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  52.88 
 
 
232 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  52.17 
 
 
845 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
220 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
241 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  43.54 
 
 
218 aa  185  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
224 aa  184  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
214 aa  184  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  43.54 
 
 
218 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  53.88 
 
 
669 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  50 
 
 
682 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
220 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  45.37 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  52.63 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  49.3 
 
 
223 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  51.69 
 
 
681 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  45.37 
 
 
216 aa  177  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
225 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  50.72 
 
 
224 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
225 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 
219 aa  174  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 
223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  51.46 
 
 
352 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  49.76 
 
 
681 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  51.21 
 
 
681 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
208 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  50.49 
 
 
230 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
230 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
229 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  54.33 
 
 
220 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
210 aa  165  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  45.63 
 
 
214 aa  165  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
232 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
459 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
227 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
227 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  50.49 
 
 
227 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
443 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
242 aa  161  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  49.77 
 
 
232 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  52.43 
 
 
668 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 
235 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  46.89 
 
 
238 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
439 aa  158  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
223 aa  158  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  48.1 
 
 
885 aa  157  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  48.1 
 
 
885 aa  157  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
441 aa  157  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  51.6 
 
 
260 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
229 aa  154  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
208 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
477 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  45.15 
 
 
209 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  44.06 
 
 
223 aa  150  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
468 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  47.57 
 
 
222 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
226 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  46.4 
 
 
232 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
222 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  45.19 
 
 
441 aa  147  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  45.75 
 
 
443 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  45.79 
 
 
216 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
437 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
221 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
446 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  47.85 
 
 
418 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  46.67 
 
 
220 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
223 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
217 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
459 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
225 aa  141  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 
234 aa  141  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
216 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  44.71 
 
 
216 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  39.9 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 
208 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  43.27 
 
 
884 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0481  phosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.675068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>