136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3615 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  58.37 
 
 
221 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  55.92 
 
 
242 aa  215  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  55.14 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 
221 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  54.38 
 
 
885 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  54.38 
 
 
885 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
222 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  51.46 
 
 
884 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
208 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
219 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
214 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  43.19 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  51.82 
 
 
669 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  46.67 
 
 
218 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  48.25 
 
 
232 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  46.67 
 
 
218 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  51.43 
 
 
232 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  50 
 
 
682 aa  175  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  45.5 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  48.56 
 
 
208 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  47.62 
 
 
216 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
220 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
216 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
235 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  50 
 
 
230 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
477 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  46.7 
 
 
441 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  49.76 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  48.83 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  47.39 
 
 
214 aa  165  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  48.1 
 
 
235 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.1 
 
 
235 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.1 
 
 
235 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
441 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0900  phosphoribosyltransferase  49.51 
 
 
202 aa  164  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.6 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  49.28 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  47.96 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  48.58 
 
 
443 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  44.6 
 
 
216 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
459 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  44.13 
 
 
216 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  47.39 
 
 
437 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
220 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
223 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  46.19 
 
 
228 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 
439 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  46.73 
 
 
210 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  47.19 
 
 
260 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
210 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  44.08 
 
 
229 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  46.54 
 
 
221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  49.29 
 
 
668 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
225 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  49.52 
 
 
459 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 
225 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  42.58 
 
 
214 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
223 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  52.73 
 
 
224 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  44.76 
 
 
845 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  44.76 
 
 
679 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  44.76 
 
 
679 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
222 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
232 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  48.08 
 
 
216 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  47.87 
 
 
418 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  43.75 
 
 
681 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
229 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  44.04 
 
 
214 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
215 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
215 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 
217 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  46.19 
 
 
238 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  46.7 
 
 
209 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  44.5 
 
 
681 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
245 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0136  phosphoribosyltransferase  38.68 
 
 
218 aa  141  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00508045  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  47.66 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  46.48 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  44.76 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  48.06 
 
 
446 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
232 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 
223 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  43.06 
 
 
681 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  44.66 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  45.71 
 
 
352 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2042  phosphoribosyltransferase  44.34 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
468 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>