135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0900 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0900  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 202 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 		 221 aa  204  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  47.64 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  49.04 
 
 		 885 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  49.04 
 
 		 885 aa  170  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  48.85 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  51.95 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  45.87 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  48.86 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  40.1 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  40.1 
 
 		 884 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  33.8 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  38.79 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  44.55 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  36.65 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  36.65 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  41.04 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 		 229 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1158  phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  37.98 
 
 		 679 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  37.98 
 
 		 679 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  37.8 
 
 		 845 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  38.25 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  40.09 
 
 		 441 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  46.33 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  36.19 
 
 		 682 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  40.39 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  39.81 
 
 		 443 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 477 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  40.52 
 
 		 260 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  34.74 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  34.74 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  36.74 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  40.38 
 
 		 668 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 459 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  37.98 
 
 		 669 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  36.27 
 
 		 352 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  36.94 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  36.94 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  36.94 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  38.21 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  38.57 
 
 		 418 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  38.28 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  35.43 
 
 		 223 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 		 459 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  35.47 
 
 		 681 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1594  phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 		 217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  38.05 
 
 		 681 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  33.8 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 		 210 aa  107  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  36.06 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  41.99 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  40.09 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  37.04 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  39.56 
 
 		 681 aa  101  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  42.29 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  39.27 
 
 		 443 aa  101  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  35.45 
 
 		 441 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  37.56 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 		 437 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  40.22 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>