147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5577 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5577  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  40.76 
 
 
232 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  38.35 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  40.47 
 
 
235 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  40.47 
 
 
235 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  40.47 
 
 
235 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 
220 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0654  phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 
232 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  35.85 
 
 
217 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  42.72 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  40.93 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  38.57 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  40.19 
 
 
241 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
222 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  41.43 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  37.09 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  37.09 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
441 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1814  phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.055799  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  39.9 
 
 
679 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  39.9 
 
 
679 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  36.11 
 
 
218 aa  125  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
209 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
459 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  39.9 
 
 
845 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
219 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  40 
 
 
682 aa  124  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  39.53 
 
 
352 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  38.43 
 
 
223 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  37.75 
 
 
223 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  41.47 
 
 
223 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  39.81 
 
 
214 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  38.68 
 
 
681 aa  122  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  35.65 
 
 
218 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
439 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  40.39 
 
 
226 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3617  phosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
210 aa  121  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  36.84 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  38.07 
 
 
477 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  37.5 
 
 
224 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1590  phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 
235 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0798935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
211 aa  119  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 
222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  42 
 
 
446 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4550  phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 
210 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  36.28 
 
 
242 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  38.18 
 
 
669 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 
437 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
227 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
227 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  38.5 
 
 
227 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  36.71 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4797  phosphoribosyltransferase  31.92 
 
 
224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  40.49 
 
 
443 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
230 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5062  phosphoribosyltransferase  37.81 
 
 
210 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  37.44 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1135  phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1014  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 
468 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0570388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  36.4 
 
 
885 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  36.4 
 
 
885 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  36.84 
 
 
441 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  40.09 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 
443 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2650  phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0342  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 
459 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  39.25 
 
 
668 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  36.59 
 
 
681 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  36.63 
 
 
220 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  38.3 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  41.06 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0716  phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  35.41 
 
 
230 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
222 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  39.25 
 
 
222 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  35.61 
 
 
681 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2961  phosphoribosyltransferase  36.74 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000716325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_696  phosphoribosyl transferase domain protein  37.66 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2613  phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0790  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  37.66 
 
 
244 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.582964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4124  phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 
220 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 
207 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1949  phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
225 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2042  phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
222 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  36.36 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0136  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
218 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00508045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0137  phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 
232 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>