More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0800 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0800  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1108    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 532 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  35.45 
 
 		 516 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  35.14 
 
 		 529 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 540 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 509 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 		 520 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 		 525 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  33.96 
 
 		 522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 517 aa  260  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  35.95 
 
 		 529 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  34.91 
 
 		 521 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 513 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 537 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 537 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 1043 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  33.71 
 
 		 537 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  35.44 
 
 		 534 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 534 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 499 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.84 
 
 		 561 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.79 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.79 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.79 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.97 
 
 		 561 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 534 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.61 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 528 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.61 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.42 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.61 
 
 		 561 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 		 577 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 		 514 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 510 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 510 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 510 aa  236  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 510 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 510 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.33 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.38 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 528 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.13 
 
 		 510 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 549 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 512 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  31.35 
 
 		 557 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 525 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 590 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 544 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 591 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 536 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 564 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 511 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.44 
 
 		 533 aa  224  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 516 aa  223  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 493 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 534 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 585 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0351635  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 567 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 514 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 566 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 569 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 531 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 559 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.11 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.38 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  29.61 
 
 		 587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 506 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 530 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.53 
 
 		 525 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5576  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 		 519 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 578 aa  216  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.46 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 		 526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  29.93 
 
 		 576 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.3 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.3 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>