121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0262 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  236  5.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  34.78 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  35.16 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  30.59 
 
 
266 aa  60.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  31.11 
 
 
238 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  25.27 
 
 
266 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  24.18 
 
 
266 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  38.36 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  28.87 
 
 
267 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  39.29 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  31.25 
 
 
261 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0746  protein of unknown function DUF59  30.85 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2676  ATPase-like, ParA/MinD  35.71 
 
 
365 aa  52  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0710053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  35.71 
 
 
391 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  36.49 
 
 
314 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  24.72 
 
 
287 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  37.84 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  27.47 
 
 
271 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  30.59 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  35.53 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1982  serine O-acetyltransferase  27.66 
 
 
320 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0968  protein of unknown function DUF59  30.67 
 
 
371 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  30.95 
 
 
256 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  32.61 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  33.01 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3588  mrp protein  35.53 
 
 
349 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3671  mrp protein  39.34 
 
 
349 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  36.76 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  34.52 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3357  mrp protein  35.94 
 
 
349 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.330315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3321  ATP-binding mrp protein  35.94 
 
 
349 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3271  ATP-binding mrp protein  35.94 
 
 
349 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3620  mrp protein  35.94 
 
 
349 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  35.9 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1755  hypothetical protein  35.21 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000415321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  37.84 
 
 
356 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0029  hypothetical protein  34.09 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.150772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  27.84 
 
 
260 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  32.04 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  31.4 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  33.75 
 
 
353 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  35.06 
 
 
353 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3578  mrp protein  37.7 
 
 
349 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1569  hypothetical protein  31.58 
 
 
349 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118472  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  33.77 
 
 
100 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3571  mrp protein  37.7 
 
 
349 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.983945 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  36 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  36.49 
 
 
356 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1646  mrp protein  31.71 
 
 
349 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3149  protein of unknown function DUF59  30.14 
 
 
131 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.894372  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  30.49 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  32.05 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  36.14 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  35.82 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  34.29 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  33.73 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  31.43 
 
 
359 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  31.71 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  34.15 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  35.37 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  32.58 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  34.67 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1494  predicted protein  30.65 
 
 
438 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  31.33 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  29.89 
 
 
238 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0663  hypothetical protein  28.77 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  32.1 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  36 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2837  hypothetical protein  30.14 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00762998  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  34.15 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2597  protein of unknown function DUF59  33.77 
 
 
356 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0491781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  49.09 
 
 
105 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  36.54 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  29.79 
 
 
349 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  32.89 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1234  hypothetical protein  26.58 
 
 
370 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  44.44 
 
 
361 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  35.23 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0809  hypothetical protein  26.83 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0067  chromosome partitioning ATPase  33.33 
 
 
371 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  37.14 
 
 
390 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  24.76 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  41.3 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1793  hypothetical protein  29.47 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  52.27 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0925  hypothetical protein  30.21 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0863  hypothetical protein  30.53 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.162032  hitchhiker  0.0095547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2130  hypothetical protein  36.36 
 
 
361 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.132517 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0896  hypothetical protein  27.16 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00569977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1319  protein of unknown function DUF59  43.48 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  25.64 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7792  protein of unknown function DUF59  37.14 
 
 
384 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  27.91 
 
 
381 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  35.14 
 
 
356 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  27.91 
 
 
381 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>