36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3495 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
271 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  62.83 
 
 
261 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  61 
 
 
260 aa  258  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  54.46 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  44.59 
 
 
234 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  45.25 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  39.11 
 
 
266 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  37.82 
 
 
287 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  37.89 
 
 
266 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  34.12 
 
 
267 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  38.12 
 
 
256 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  28.09 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  34.97 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  30.19 
 
 
138 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  27.47 
 
 
118 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  38.75 
 
 
379 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0075  hypothetical protein  30.21 
 
 
370 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  34.18 
 
 
381 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  35.87 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0809  hypothetical protein  35.71 
 
 
108 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  33.98 
 
 
390 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1054  hypothetical protein  31.03 
 
 
99 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  34.38 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0863  hypothetical protein  28.74 
 
 
99 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.162032  hitchhiker  0.0095547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  32.65 
 
 
381 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  34.65 
 
 
387 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  37.36 
 
 
377 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  30.93 
 
 
384 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  32.56 
 
 
381 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  32.56 
 
 
381 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  32.56 
 
 
381 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
315 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2608  hypothetical protein  33.85 
 
 
196 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  34.07 
 
 
375 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1793  hypothetical protein  32.95 
 
 
99 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  32.1 
 
 
347 aa  42  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>