19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3635 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  60.17 
 
 		 287 aa  258  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  50.63 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  43.05 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  43.05 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  39.91 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  36.64 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  36.2 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  33.91 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  37.28 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  33.73 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  31.45 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  31.25 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  26.79 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  28.87 
 
 		 118 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0029  hypothetical protein  30 
 
 		 100 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.150772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  32.5 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  39.71 
 
 		 356 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0746  protein of unknown function DUF59  24.72 
 
 		 94 aa  42.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>