41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1749 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
260 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  59.05 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  61 
 
 
271 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  49.56 
 
 
238 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  44.93 
 
 
231 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  40.08 
 
 
234 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  40.89 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  40.08 
 
 
266 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  37.92 
 
 
287 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  37.89 
 
 
256 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  33.62 
 
 
267 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  33.15 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  29.44 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  26.72 
 
 
138 aa  59.3  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  42.27 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  40.23 
 
 
381 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  42.86 
 
 
375 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  43.68 
 
 
375 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  36.27 
 
 
381 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27850  chromosome partitioning ATPase  40.23 
 
 
387 aa  52  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.748348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  40.45 
 
 
381 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  37.21 
 
 
381 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  37.21 
 
 
381 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  37.21 
 
 
381 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  34.65 
 
 
375 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  41.3 
 
 
383 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  38.1 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  39.33 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  27.84 
 
 
118 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  41.03 
 
 
411 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0708  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  41.67 
 
 
379 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  41.03 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  36.45 
 
 
378 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  40.74 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  36.05 
 
 
390 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2486  ATPase-like, ParA/MinD  43.59 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.168186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  38.1 
 
 
381 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  35.29 
 
 
361 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  37.04 
 
 
181 aa  42.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2935  hypothetical protein  39.36 
 
 
377 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>