40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3556 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  100 
 
 		 261 aa  522  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  62.83 
 
 		 271 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  59.05 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  48.03 
 
 		 238 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  43.69 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  41.89 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  38.24 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  37.13 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  37.28 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  35.29 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  37.12 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  28.29 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  30.63 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  40.24 
 
 		 390 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  31.25 
 
 		 118 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  38.1 
 
 		 381 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  37.35 
 
 		 378 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  37.8 
 
 		 379 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  36.9 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  36.9 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8411  hypothetical protein  40 
 
 		 380 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  35.71 
 
 		 375 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  36.9 
 
 		 381 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3011  hypothetical protein  37.33 
 
 		 378 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  35.71 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  36.36 
 
 		 411 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1127  ATPase-like, ParA/MinD  33.73 
 
 		 383 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1445  hypothetical protein  38.36 
 
 		 387 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 		 374 aa  45.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  35 
 
 		 391 aa  45.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  32.93 
 
 		 381 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0326  hypothetical protein  34.72 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  34.83 
 
 		 375 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  30.49 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  33.8 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 		 353 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  32.93 
 
 		 383 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1054  hypothetical protein  28.74 
 
 		 99 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  31.86 
 
 		 388 aa  42  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>