27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1957 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  46.02 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  43.69 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  40.87 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  44.59 
 
 		 271 aa  148  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  40.34 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  40.08 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  40.35 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  40.43 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  36.84 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  35.53 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  32.58 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  30.93 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  28.95 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0691  hypothetical protein  26.06 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0228073  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2174  hypothetical protein  42.31 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309349  normal  0.626459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2544  ATPase-like, ParA/MinD  42.31 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4109  protein of unknown function DUF59  39.73 
 
 		 353 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4070  protein of unknown function DUF59  39.73 
 
 		 353 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  29.11 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  30.77 
 
 		 185 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1054  hypothetical protein  30.43 
 
 		 99 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  31.18 
 
 		 101 aa  42.7  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0863  hypothetical protein  28.26 
 
 		 99 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.162032  hitchhiker  0.0095547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  29.49 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1793  hypothetical protein  30.34 
 
 		 99 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>