53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2515 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  48.03 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  54.46 
 
 		 271 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  49.56 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  48.65 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  46.02 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  42.79 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  41.74 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  41.74 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  40.91 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  38.74 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  32.02 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  30.56 
 
 		 275 aa  101  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  28.28 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  31.11 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2512  protein of unknown function DUF59  37.84 
 
 		 381 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000076011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  41.56 
 
 		 381 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2792  hypothetical protein  35.4 
 
 		 375 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1590  chromosome partitioning ATPase  35.62 
 
 		 347 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  33.8 
 
 		 99 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  37.84 
 
 		 113 aa  45.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4583  hypothetical protein  37.84 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  34.67 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06470  chromosome partitioning ATPase  36.05 
 
 		 381 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0763  protein of unknown function DUF59  41.25 
 
 		 374 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  39.19 
 
 		 102 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  35.23 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0715  hypothetical protein  40.28 
 
 		 411 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0809  hypothetical protein  34.57 
 
 		 108 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11254  hypothetical protein  36.71 
 
 		 390 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.397293  hitchhiker  0.00931027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  36 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3055  protein of unknown function DUF59  38.03 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1165  hypothetical protein  38.03 
 
 		 356 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  36 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1188  protein of unknown function DUF59  36.84 
 
 		 383 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.518876  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  38.36 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  38.36 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  38.36 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0508  chromosome partitioning ATPase protein  35.96 
 
 		 390 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2622  ATPase-like ParA/MinD  35.14 
 
 		 356 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0029  hypothetical protein  31.76 
 
 		 100 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.150772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1824  hypothetical protein  40.85 
 
 		 389 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.824017  normal  0.196606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1105  MRP protein-like  38.36 
 
 		 361 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4492  hypothetical protein  37.8 
 
 		 375 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  40.28 
 
 		 162 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  36.62 
 
 		 110 aa  42.4  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  37.18 
 
 		 181 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1287  hypothetical protein  36.62 
 
 		 391 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.404261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0662  hypothetical protein  38.89 
 
 		 382 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  42.31 
 
 		 138 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  35.62 
 
 		 99 aa  41.6  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2205  hypothetical protein  37.5 
 
 		 375 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>