20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2797 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  96.99 
 
 
266 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  47.11 
 
 
256 aa  185  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  43.83 
 
 
287 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  42.6 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  40.5 
 
 
238 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  38.4 
 
 
261 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  40.08 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  40.35 
 
 
234 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  36.4 
 
 
271 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  35.17 
 
 
266 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  32.4 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  35.11 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  29.93 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  24.18 
 
 
118 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4064  hypothetical protein  36.71 
 
 
381 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3990  hypothetical protein  36.71 
 
 
381 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4004  hypothetical protein  36.71 
 
 
381 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578678  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1073  ATPase-like, ParA/MinD  34.67 
 
 
378 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1861  ATPase-like, ParA/MinD  30.59 
 
 
381 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>