23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4404 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4404  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.672516  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3635  hypothetical protein  60.17 
 
 
267 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.750525  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2643  hypothetical protein  52.36 
 
 
256 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0544073  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2797  hypothetical protein  44.26 
 
 
266 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1503  hypothetical protein  43.93 
 
 
266 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.312715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2515  hypothetical protein  44.54 
 
 
238 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467956  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1957  hypothetical protein  40.34 
 
 
234 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.130219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1749  protein of unknown function DUF59  38.33 
 
 
260 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3556  protein of unknown function DUF59  36.44 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4552  protein of unknown function DUF59  37.39 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3495  protein of unknown function DUF59  38.24 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3738  protein of unknown function DUF59  30.71 
 
 
275 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0728  protein of unknown function DUF59  32.07 
 
 
266 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649374  normal  0.722289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2430  protein of unknown function DUF59  26.47 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0659761  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0262  hypothetical protein  24.72 
 
 
118 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0799  protein of unknown function DUF59  36.59 
 
 
381 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.348567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  33.77 
 
 
177 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2160  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 
381 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.243982  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0746  protein of unknown function DUF59  31.71 
 
 
94 aa  43.5  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3887  ATPase-like, ParA/MinD  37.04 
 
 
379 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0528  hypothetical protein  27.63 
 
 
183 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.830297  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  42.4  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  38.16 
 
 
162 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>