143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4520 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4520  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  100 
 
 		 110 aa  229  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4278  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  94.55 
 
 		 242 aa  221  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4451  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  31.53 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  27.52 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  26.55 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  30.12 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  27.52 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  28.92 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  27.93 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  24.77 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  24.77 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4671  single-strand binding protein  27.64 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.726649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  26.67 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  29.29 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  27.52 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  24.32 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  28.75 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  24.56 
 
 		 172 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1033  single-stranded DNA-binding protein  30.84 
 
 		 191 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.391899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  29.11 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  22.41 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  29.58 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  29.11 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  29.58 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4316  single-strand binding protein  22.22 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  23.89 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  29.46 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  24.79 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  25.23 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  24.35 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 199 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  34.43 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  25.23 
 
 		 234 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 196 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  27.52 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  37.7 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  25.64 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  26.72 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3622  single-strand binding protein  23.46 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0622849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  24.76 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  36.07 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  27 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  24.55 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  26.85 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  24.55 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  24.55 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  24.55 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  24.55 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  25.49 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  25 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  24 
 
 		 195 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  24.3 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  27 
 
 		 189 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  23.15 
 
 		 157 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 184 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 184 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 236 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 236 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 184 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 235 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  28.3 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  23.68 
 
 		 236 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 234 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 236 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 234 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  24.3 
 
 		 234 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  26.13 
 
 		 184 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  28 
 
 		 183 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  27.78 
 
 		 172 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0743  single-stranded DNA-binding protein  29.91 
 
 		 164 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.323458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  26.61 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 188 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  38.96 
 
 		 189 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>