106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4204 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  75 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  71.74 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  70.65 
 
 		 92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  70 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  68.13 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  67.03 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  60.44 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  58.7 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  54.35 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  58.06 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  58.06 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  58.06 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  57.14 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  56.52 
 
 		 92 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  58.24 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  58.06 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  56.04 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  60.44 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  55.06 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  51.09 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  57.14 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  55.43 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  49.45 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  54.35 
 
 		 92 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  54.95 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  58.24 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  53.26 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  51.65 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  50 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  51.09 
 
 		 97 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  57.14 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  45.05 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  45.05 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  45.05 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  43.96 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  49.46 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  48.94 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  48.91 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  47.83 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  43.96 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  43.96 
 
 		 91 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  45.05 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  40 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.68 
 
 		 364 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  41.3 
 
 		 93 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  41.3 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  37.36 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  41.76 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  42.05 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  41.57 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  45.16 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.11 
 
 		 480 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  38.46 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  42.55 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  41.49 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  36.26 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  36.26 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  34.07 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  46.74 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  41.76 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  36.26 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  33.33 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  39.71 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  50.88 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  31.03 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  36.78 
 
 		 648 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  30.68 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  38.57 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  34.33 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  27.27 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38 
 
 		 443 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  32.97 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  23.86 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  50 
 
 		 459 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  27.17 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0157  thiamineS protein  33.82 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0105  hypothetical protein  30.12 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  26.97 
 
 		 643 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  30.67 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  29.41 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  30.67 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  36.49 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  30.88 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  32.53 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2971  MoaD family protein  36.76 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  30 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  32.53 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1264  hypothetical protein  34.07 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1240  thiamineS protein  37.66 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1003  MoaD family protein  30.77 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.183154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  31.11 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  30.86 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0699  MoaD family protein  34.18 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  30 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  27.78 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  32.18 
 
 		 639 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1062  MoaD family protein  32.35 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.156992 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>