34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5087 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  98.88 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  86.52 
 
 		 89 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  84.27 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  84.27 
 
 		 89 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  84.27 
 
 		 89 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  84.27 
 
 		 89 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  84.27 
 
 		 89 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  85.39 
 
 		 89 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  77.53 
 
 		 89 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  49.44 
 
 		 99 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  49.44 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  49.44 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  44.94 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  53.93 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  48.31 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  42.7 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  33.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  38.81 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  30.67 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  31.94 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  33.82 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  26.15 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  29.85 
 
 		 95 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  23.91 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  31.88 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  26.83 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  32.93 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  30.99 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  25.71 
 
 		 91 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>