26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3392 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  100 
 
 		 89 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  49.44 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  49.44 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  47.19 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  47.19 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  44.94 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  43.82 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  42.7 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  46.07 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  41.57 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  44.94 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  42.7 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  43.82 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  38.2 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  39.33 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  42.7 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  48.08 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  35.96 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.05 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3834  thiamineS protein  30.77 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>