25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3521 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  177  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  60.67 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  59.55 
 
 		 89 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  59.55 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  59.55 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  56.18 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  56.18 
 
 		 99 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  50.56 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  55.06 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  55.06 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  55.06 
 
 		 89 aa  100  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  53.93 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  55.06 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  55.06 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  52.81 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  50.56 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  51.69 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  43.82 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  47.19 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  46.15 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  27.54 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  36.76 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  33.82 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>