37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04773 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  85.39 
 
 		 89 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  84.27 
 
 		 89 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  87.64 
 
 		 89 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  80.9 
 
 		 89 aa  153  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  77.53 
 
 		 89 aa  153  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  77.53 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  77.53 
 
 		 89 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  77.53 
 
 		 89 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  60.67 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  47.19 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  52.81 
 
 		 98 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  53.93 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  53.93 
 
 		 89 aa  95.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  53.93 
 
 		 89 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  57.78 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  59.55 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  46.07 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  49.44 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  49.44 
 
 		 89 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  33.33 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  32.04 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  27.5 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  33.82 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  32.53 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  30.49 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  38.46 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  43.9 
 
 		 90 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  37.18 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  28.57 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  25 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  31.88 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  29.17 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  32.53 
 
 		 93 aa  40  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  32.89 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  33.33 
 
 		 91 aa  40  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>