26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5164 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  97.75 
 
 
89 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  86.52 
 
 
89 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  85.39 
 
 
89 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  85.39 
 
 
89 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  84.27 
 
 
89 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  77.53 
 
 
114 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  77.53 
 
 
89 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  68.54 
 
 
89 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  55.06 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  47.19 
 
 
98 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  51.69 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  51.69 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  44.94 
 
 
99 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  44.94 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  42.7 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  44.94 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  44.94 
 
 
89 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  42.7 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  42.7 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  37.1 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  31.67 
 
 
98 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  25 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  26.39 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  28.36 
 
 
95 aa  40  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>