79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2823 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  100 
 
 
98 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  36.67 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  37.78 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  36.67 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  36.67 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  37.78 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  35.56 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  35.56 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  35.56 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  30 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.87 
 
 
364 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  38.67 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  34.44 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  35.56 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  34.44 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  34.44 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.56 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  33.33 
 
 
92 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  32.22 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  40.62 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  30.68 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  40.86 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  31.87 
 
 
91 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  30 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  30.68 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  32.61 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  39.06 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  30 
 
 
92 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  34.78 
 
 
124 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  33.33 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  31.87 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  36.76 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  41.18 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  32.22 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  33.33 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  34.44 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  35.56 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  32.04 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  34.44 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  33.7 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  37.68 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  28.57 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  30 
 
 
93 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  31.43 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  32.22 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  31.43 
 
 
90 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  28.26 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  28.4 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  36.92 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  38.24 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  34.44 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  32.86 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  31.11 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  35.21 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  30.43 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  30.43 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  30.43 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  35.21 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  31.82 
 
 
643 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  33.82 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  33.82 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  28.57 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  31.67 
 
 
89 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  31.67 
 
 
89 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  32.91 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  34.29 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  32.99 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  28.57 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  40.82 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  27.96 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  29.67 
 
 
90 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  40.32 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  37.04 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  34.09 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  36 
 
 
87 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  36.11 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  34.43 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  34.18 
 
 
89 aa  40  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>