90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1697 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  100 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  70 
 
 
90 aa  134  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  70 
 
 
90 aa  130  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  68.89 
 
 
90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  65.56 
 
 
92 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  67.74 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  67.74 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  67.74 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  66.67 
 
 
93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  66.67 
 
 
90 aa  124  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  65.56 
 
 
90 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  64.44 
 
 
92 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  63.33 
 
 
92 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  60 
 
 
92 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  60 
 
 
97 aa  117  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  61.11 
 
 
90 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  61.54 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  57.78 
 
 
90 aa  114  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  57.78 
 
 
92 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  63.44 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  64.52 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  59.34 
 
 
92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  57.14 
 
 
112 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  57.14 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  56.04 
 
 
91 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  58.24 
 
 
92 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  48.89 
 
 
90 aa  103  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  58.89 
 
 
92 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  54.95 
 
 
92 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  56.04 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  52.22 
 
 
90 aa  97.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  54.95 
 
 
93 aa  97.4  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  52.75 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  45.05 
 
 
92 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  42.86 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  47.13 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  48.86 
 
 
91 aa  87.8  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  41.76 
 
 
91 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  42.86 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  42.86 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  42.86 
 
 
92 aa  81.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  43.48 
 
 
92 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  38.46 
 
 
91 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 
364 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  40.66 
 
 
91 aa  77  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  37.36 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  37.36 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  39.56 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  40.43 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  43.01 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  35.16 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  35.16 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  35.16 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  37.78 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40 
 
 
480 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  38.64 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  41.05 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  38.3 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  43.48 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  35.87 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  32.61 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  43.01 
 
 
96 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.85 
 
 
443 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  41.79 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  41.18 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  52.08 
 
 
459 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  36.36 
 
 
95 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1003  MoaD family protein  37.5 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.183154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  33.33 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  28.41 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1062  MoaD family protein  35.82 
 
 
92 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.156992 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  28.57 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  29.89 
 
 
643 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  31.82 
 
 
648 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  32.94 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  32.43 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  35.53 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  35.29 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0157  thiamineS protein  31.34 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2668  MoaD family protein  32.81 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  43.33 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  28.57 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  28.41 
 
 
639 aa  41.6  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1240  thiamineS protein  32.81 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  27.59 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1019  hypothetical protein  34.48 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.093317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  33.33 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  34.48 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0311166 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  36.36 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0178414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>