103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1847 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  100 
 
 
96 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  48.91 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  48.91 
 
 
92 aa  94  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  52.27 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  54.44 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  48.91 
 
 
92 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  54.35 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  52.17 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  42.39 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  53.26 
 
 
92 aa  87.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  44.57 
 
 
91 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  51.65 
 
 
92 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  46.59 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  47.83 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  46.74 
 
 
92 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.91 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  50 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  42.39 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  42.39 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  41.3 
 
 
93 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  46.74 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  46.74 
 
 
90 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  46.74 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  43.48 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.74 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  42.7 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  38.04 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  44.57 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  45.74 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  44.57 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  42.39 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  44.44 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  46.74 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  43.48 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  49.45 
 
 
480 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  44.57 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  40.22 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  40.22 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  43.48 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  46.81 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  41.49 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  45.65 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  47.31 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  46.74 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  46.81 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  47.83 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  40.43 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  40.43 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  40.43 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  46.81 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  46.81 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  38.04 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  42.55 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.39 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  41.76 
 
 
98 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.11 
 
 
364 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  43.01 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  36.67 
 
 
90 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  43.48 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  41.3 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  41.49 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1291  thiamineS protein  40.45 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  43.33 
 
 
648 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  42.39 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  33.33 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1827  hypothetical protein  37.08 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.330867  hitchhiker  0.0000000000149093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  34.78 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  36.96 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  37.5 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  31.11 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  34.78 
 
 
92 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1019  hypothetical protein  41.57 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.093317 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  36.05 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1335  MoaD family protein  35.87 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0105  hypothetical protein  41.18 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  51.11 
 
 
459 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  34.07 
 
 
91 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.29 
 
 
443 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1415  molybdopterin converting factor small subunit MoaD  31.58 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00239633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0496  molybdopterin converting factor small subunit  34.38 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  34.09 
 
 
643 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  38.2 
 
 
90 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0311166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  39.71 
 
 
89 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  39.77 
 
 
639 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  31.87 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  39.29 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  36.76 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  36.76 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  31.4 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2128  MoaD family protein  32.61 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  32.26 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0157  thiamineS protein  40.3 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  34.52 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  27.17 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  33.7 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0178414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  36.76 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  35.29 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  35.29 
 
 
89 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1003  MoaD family protein  31.94 
 
 
95 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.183154 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  35.29 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>