86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1010 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  100 
 
 
90 aa  178  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  78.89 
 
 
92 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  72.04 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  72.04 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  72.04 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  71.43 
 
 
92 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  71.11 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  71.11 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  69.89 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  68.89 
 
 
101 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  71.11 
 
 
90 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  66.67 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  67.78 
 
 
92 aa  123  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  66.67 
 
 
92 aa  123  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  67.03 
 
 
112 aa  120  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  66.67 
 
 
92 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  63.33 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  65.93 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  64.44 
 
 
90 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  62.37 
 
 
142 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  64.44 
 
 
92 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  61.54 
 
 
92 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  62.22 
 
 
97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  60.44 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  59.34 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  61.54 
 
 
91 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  61.29 
 
 
124 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  59.34 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  60.67 
 
 
92 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  52.22 
 
 
90 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  54.95 
 
 
92 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  53.85 
 
 
92 aa  100  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  54.44 
 
 
90 aa  97.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  50.55 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  52.75 
 
 
92 aa  95.5  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  52.17 
 
 
92 aa  95.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  50.55 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  50.55 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  51.65 
 
 
90 aa  90.9  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  49.45 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  52.75 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  47.25 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  47.25 
 
 
91 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  48.86 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  43.96 
 
 
91 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.19 
 
 
364 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  49.46 
 
 
93 aa  80.1  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  43.96 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  43.96 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  42.86 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  41.11 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  42.55 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  42.55 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40 
 
 
480 aa  67  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  36.26 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  35.16 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  37.36 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  37.93 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  35.16 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.78 
 
 
443 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  41.3 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  38.04 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  43.48 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  34.41 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  37.93 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  34.83 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1062  MoaD family protein  35.87 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.156992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  31.52 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  36.26 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0157  thiamineS protein  31.34 
 
 
94 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  31.11 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  47.62 
 
 
459 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  34.48 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0311166 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1240  thiamineS protein  35.71 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1264  hypothetical protein  32.22 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  32.84 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1019  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.093317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  34.78 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  41.67 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1003  MoaD family protein  31.25 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.183154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  34.07 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  30.43 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  31.58 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  28.74 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  29.89 
 
 
643 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  33.33 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0178414 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>