86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0990 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  100 
 
 
112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  95.54 
 
 
112 aa  209  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  68.14 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  77.17 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  62.93 
 
 
124 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  75 
 
 
92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  68.13 
 
 
91 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  71.43 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  71.74 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  70.65 
 
 
97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  69.23 
 
 
92 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  67.39 
 
 
92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  65.22 
 
 
92 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  67.03 
 
 
90 aa  120  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  65.93 
 
 
90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  64.84 
 
 
90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  62.37 
 
 
93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  61.29 
 
 
93 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  61.29 
 
 
93 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  61.29 
 
 
93 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  64.84 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  64.84 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  64.84 
 
 
90 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  57.14 
 
 
101 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  51.09 
 
 
92 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  50 
 
 
92 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  49.45 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  48.39 
 
 
93 aa  97.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  53.93 
 
 
92 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  48.91 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  50.55 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  48.35 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  52.75 
 
 
91 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  53.85 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  47.25 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  42.86 
 
 
91 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  41.76 
 
 
91 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.56 
 
 
364 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  41.76 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  42.86 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  46.15 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  42.86 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  42.86 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  44.83 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  40.22 
 
 
92 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  42.86 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  41.76 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  41.76 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  42.05 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  46.24 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  38.04 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  41.76 
 
 
94 aa  70.1  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  36.26 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  42.55 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  36.26 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  34.07 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  44.57 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  35.16 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  38.04 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.16 
 
 
443 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  39.13 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  38.3 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.26 
 
 
480 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  37.89 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  35.96 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  34.78 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  32.18 
 
 
643 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  35.29 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  38.46 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0178414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  47.73 
 
 
459 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  35.82 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  32.58 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  30.11 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  35.11 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0699  MoaD family protein  29.17 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  32.18 
 
 
648 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  32.84 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  22.35 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  29.67 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  30.43 
 
 
92 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0009  MoaD family protein  31.52 
 
 
92 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.555142  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2971  MoaD family protein  29.79 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  25.29 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1264  hypothetical protein  32.22 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  32.86 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  31.03 
 
 
90 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0311166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>