86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1101 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  95.54 
 
 		 112 aa  209  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  69.52 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  75 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  77.17 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  64.29 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  69.23 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  70.65 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  69.57 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  69.23 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  69.57 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  67.03 
 
 		 92 aa  122  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  68.13 
 
 		 90 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  65.93 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  63.04 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  62.64 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  60.22 
 
 		 93 aa  114  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  64.84 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  65.93 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  59.14 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  59.14 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  59.14 
 
 		 93 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  62.64 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  57.14 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  48.91 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  48.39 
 
 		 93 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  48.91 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  47.25 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  47.83 
 
 		 92 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  51.69 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  48.35 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  49.45 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  51.65 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  53.85 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  43.96 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  47.25 
 
 		 92 aa  87.4  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  42.86 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  42.86 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  47.25 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  42.86 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  43.96 
 
 		 91 aa  84.3  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  42.86 
 
 		 92 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  42.86 
 
 		 93 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.33 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  41.3 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  43.68 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  42.86 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  42.86 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  39.77 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  39.13 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  45.16 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  42.86 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  36.26 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 		 443 aa  67  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  35.16 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  40.43 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  43.48 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  32.97 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  34.07 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.36 
 
 		 480 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  39.13 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  37.23 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  37.89 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  36.96 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  35.87 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  35.96 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  32.18 
 
 		 643 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  37.31 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  47.73 
 
 		 459 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  38.46 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0178414 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  35.29 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  33.71 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0699  MoaD family protein  31.25 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  31.18 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  35.11 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  24.71 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2668  MoaD family protein  31.11 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2971  MoaD family protein  31.91 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  31.03 
 
 		 648 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  32.84 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  29.67 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  31.52 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0009  MoaD family protein  32.61 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.555142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  30.43 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0157  thiamineS protein  30.88 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1062  MoaD family protein  34.33 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.156992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>