63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4986 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  55.81 
 
 
85 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  45.35 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  35.96 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  39.33 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  38.2 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.7 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.08 
 
 
364 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  34.48 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  40.45 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  32.58 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  35.96 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  34.83 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  34.83 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  41.57 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  38.2 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  37.08 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  33.33 
 
 
92 aa  58.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  35.96 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.96 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  37.08 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  37.36 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  34.83 
 
 
92 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  32.58 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  38.67 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  35.96 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  38.2 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  36.26 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  37.08 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  31.11 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  38.2 
 
 
97 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  28.09 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  31.46 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  35.96 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.83 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  36.26 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  29.21 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  31.46 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  31.46 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  36.17 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  32.97 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  32.97 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  32.97 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  33.71 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  34.83 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  29.21 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  30.34 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  32.58 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  28.09 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  29.55 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.34 
 
 
480 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  31.87 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  29.21 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  29.89 
 
 
643 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  29.89 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  32.58 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  32.58 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  35.29 
 
 
100 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  28.41 
 
 
89 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  28.41 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  28.41 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  35.82 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  26.97 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>