92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0227 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  78.26 
 
 		 92 aa  148  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  80 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  75 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  72.83 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  73.63 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  68.13 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  64.52 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  64.52 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  64.52 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  64.52 
 
 		 93 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  63.74 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  61.54 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  57.61 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  57.61 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  58.24 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  59.34 
 
 		 101 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  57.61 
 
 		 92 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  57.14 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  52.17 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  52.75 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  57.14 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  56.32 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  48.91 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  52.17 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  53.85 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  51.09 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  49.45 
 
 		 92 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  53.19 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  48.35 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  48.91 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  51.09 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  50 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  48.91 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  52.75 
 
 		 90 aa  94.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  47.83 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  50.55 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  50.54 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  48.35 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  45.05 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.67 
 
 		 364 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  48.91 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  43.96 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  45.05 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  45.05 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  41.76 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  42.22 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  44.32 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  46.15 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  40.66 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  44.09 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.22 
 
 		 480 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  39.77 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  38.46 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  39.36 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  41.49 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  36.26 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  35.16 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  35.16 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  46.74 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  33.7 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  34.78 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  39.13 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  31.03 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6103  thiamineS protein  28.89 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.125716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  34.74 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  48.28 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  31.46 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  30 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0699  MoaD family protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  31.03 
 
 		 643 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  38.57 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0311166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  23.53 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  35.96 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  32.89 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  33.71 
 
 		 648 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0105  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1291  thiamineS protein  35.71 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  32.35 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  28.26 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1827  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.330867  hitchhiker  0.0000000000149093 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  26.6 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1264  hypothetical protein  32.58 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  34.21 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  31.65 
 
 		 90 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1019  hypothetical protein  34.29 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.093317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  45.24 
 
 		 459 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  32.97 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0475  MoaD family protein  34.67 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  29.21 
 
 		 639 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1062  MoaD family protein  31.91 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.156992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>