106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2369 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  80 
 
 
97 aa  144  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  77.17 
 
 
92 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  75 
 
 
92 aa  140  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  71.74 
 
 
92 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  74.44 
 
 
90 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  72.22 
 
 
90 aa  134  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  69.57 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  69.23 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  65.56 
 
 
90 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  67.03 
 
 
112 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  62.37 
 
 
142 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  61.96 
 
 
92 aa  120  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  60 
 
 
101 aa  120  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  66.67 
 
 
90 aa  120  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  63.74 
 
 
91 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  62.22 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  64.44 
 
 
90 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  60.87 
 
 
92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  63.33 
 
 
90 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  61.29 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  61.29 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  61.29 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  59.14 
 
 
93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  61.29 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  58.24 
 
 
92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  57.61 
 
 
92 aa  107  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  52.75 
 
 
91 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  52.17 
 
 
92 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  56.18 
 
 
92 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  53.26 
 
 
92 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  52.75 
 
 
90 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  53.85 
 
 
91 aa  100  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  52.17 
 
 
93 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  54.44 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  49.45 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  54.95 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  47.78 
 
 
90 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  50.55 
 
 
91 aa  93.6  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  47.25 
 
 
91 aa  92  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  45.16 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  48.91 
 
 
92 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  43.48 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.56 
 
 
364 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  45.05 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  47.25 
 
 
91 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  47.25 
 
 
91 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  49.43 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  46.24 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  49.46 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  44.32 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  43.62 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  40.45 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  48.91 
 
 
96 aa  73.6  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  38.46 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40 
 
 
480 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  36.26 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  38.46 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  37.36 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  40.43 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  35.87 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1542  MoaD family protein  39.36 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  38.04 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  39.13 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  36.78 
 
 
643 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  37.08 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.56 
 
 
443 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  33.72 
 
 
639 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  35.56 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0178414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  32.56 
 
 
648 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  35.82 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1019  hypothetical protein  37.93 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.093317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  54.76 
 
 
459 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0723  hypothetical protein  32.22 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142051  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  31.03 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1062  MoaD family protein  34.78 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.156992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  36.26 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  34.83 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  34.44 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  32.22 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  36.26 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  35.63 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0311166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  34.07 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1291  thiamineS protein  35.63 
 
 
90 aa  47  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1827  hypothetical protein  32.95 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.330867  hitchhiker  0.0000000000149093 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  41.18 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1003  MoaD family protein  26.87 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.183154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2128  MoaD family protein  33.7 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  33.33 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1335  MoaD family protein  33.7 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383136  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  34.41 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02720  molybdopterin biosythesis protein, MoaD  24.71 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0699  MoaD family protein  28.12 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0157  thiamineS protein  28.79 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1415  molybdopterin converting factor small subunit MoaD  28.26 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00239633  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0009  MoaD family protein  31.52 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.555142  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0384  MoaD family protein  35.82 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0475  MoaD family protein  30.34 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  31.52 
 
 
92 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0580  MoaD family protein  32.26 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>