40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1019 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1019  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  174  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.093317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  84.44 
 
 
90 aa  149  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0311166 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1291  thiamineS protein  81.11 
 
 
90 aa  141  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1827  hypothetical protein  74.44 
 
 
90 aa  132  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.330867  hitchhiker  0.0000000000149093 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  52.22 
 
 
96 aa  84  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0178414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  36.67 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  33.33 
 
 
92 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  35.63 
 
 
97 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  37.93 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  41.38 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.78 
 
 
480 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  33.33 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  32.18 
 
 
91 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  33.33 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  32.22 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  44.44 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  32.22 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  33.33 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  34.48 
 
 
643 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  29.89 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  33.33 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  31.03 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  33.33 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  34.83 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  32.86 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  34.29 
 
 
93 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  31.46 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  31.46 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3834  thiamineS protein  38.75 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  31.46 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  31.03 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  33.33 
 
 
91 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  29.89 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  34.29 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  34.48 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  33.33 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  29.89 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  37.65 
 
 
639 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.57 
 
 
364 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  30.68 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>