82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1461 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  100 
 
 
93 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  58.51 
 
 
94 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  48.94 
 
 
94 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  50.54 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  53.76 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  50.54 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  53.76 
 
 
90 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  49.46 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  49.46 
 
 
91 aa  84.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  54.35 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  50.54 
 
 
92 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  49.46 
 
 
92 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  56.52 
 
 
95 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.39 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  45.26 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  45.26 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  45.26 
 
 
93 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  49.46 
 
 
90 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  45.16 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  49.46 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  49.46 
 
 
90 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  39.78 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  44.68 
 
 
91 aa  76.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  44.09 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  38.71 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  46.24 
 
 
92 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  46.24 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  37.63 
 
 
93 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  36.56 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.16 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  46.24 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  32.26 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  45.16 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  42.39 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.68 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  41.05 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  36.56 
 
 
92 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  45.16 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  37.63 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  44.09 
 
 
91 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  36.56 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  41.94 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  45.16 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  43.01 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  43.01 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  44.68 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  32.26 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  33.33 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  33.33 
 
 
91 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  34.83 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.96 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  34.41 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  46.32 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  40.86 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  40 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  47.31 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  42.11 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  30.11 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  34.44 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  35.96 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  39.71 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.3 
 
 
480 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  31.52 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1996  MoaD family protein  38.04 
 
 
94 aa  49.7  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.416193  normal  0.106112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1564  MoaD family protein  37.88 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1069  thiamineS protein  39.13 
 
 
96 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0178414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1709  ThiS domain-containing protein  43.33 
 
 
87 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1264  hypothetical protein  35.96 
 
 
87 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.81 
 
 
443 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2077  hypothetical protein  34.83 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0311166 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  30.85 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  33.82 
 
 
92 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  34.94 
 
 
91 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1019  hypothetical protein  34.83 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.093317 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3834  thiamineS protein  31.34 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1827  hypothetical protein  34.44 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.330867  hitchhiker  0.0000000000149093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  40.32 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0009  MoaD family protein  24.73 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.555142  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  36.36 
 
 
90 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  32.93 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2971  MoaD family protein  36.36 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128048  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  32.93 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>