78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4875 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  100 
 
 
94 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4361  thiamineS protein  55.32 
 
 
94 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00663017  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1461  thiamineS protein  58.51 
 
 
93 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1290  thiamineS protein  50 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3300  thiamineS protein  48.94 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.330741  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  42.55 
 
 
92 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7560  thiamineS protein  45.74 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  43.62 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0937  MoaD family protein  46.81 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771117  normal  0.577382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0950  thiamineS protein  42.55 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0115  MoaD family protein  38.3 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3986  thiamineS protein  43.62 
 
 
93 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0722  thiamineS protein  39.36 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290197  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1357  thiamineS protein  39.36 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0317  thiamineS protein  38.3 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.114297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0227  hypothetical protein  41.49 
 
 
92 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.861343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8912  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.49 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4090  thiamineS protein  42.39 
 
 
95 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3865  thiamineS protein  44.57 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.262716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1010  thiamineS protein  42.55 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1688  thiamineS protein  43.62 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000869432  hitchhiker  0.00000468877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1781  hypothetical protein  36.17 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1727  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.55 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.974961  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29170  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.11 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.710277 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3923  thiamineS protein  38.54 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3835  thiamineS protein  38.54 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.106741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3849  thiamineS  38.54 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2353  thiamineS protein  37.5 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426187  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.56 
 
 
364 aa  67.4  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1966  thiamineS protein  41.49 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.318121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3192  MoaD family protein  44.68 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0325536  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0808  MoaD family protein  31.91 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4953  thiamineS  32.98 
 
 
91 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2369  hypothetical protein  40.43 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1697  thiamineS protein  41.05 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107223  normal  0.172927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4292  thiamineS protein  38.3 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0594  MoaD family protein  32.98 
 
 
92 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1311  thiamineS protein  41.49 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3647  thiamineS protein  38.3 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0802  thiamineS protein  39.13 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.954228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0382  thiamineS protein  41.05 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104053  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3872  thiamineS protein  40.43 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2961  thiamineS protein  31.91 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4349  MoaD family protein  29.79 
 
 
91 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0984498  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4177  thiamineS protein  33.33 
 
 
90 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547124  normal  0.802197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  33.7 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3606  thiamineS protein  35.11 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0390874  normal  0.0482836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3494  thiamineS  36.17 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1540  MoaD family protein  32.98 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0990  thiamineS protein  38.3 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.257173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4027  thiamineS protein  31.91 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.62 
 
 
480 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1101  thiamineS protein  37.23 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.925489 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3578  thiamineS protein  37.23 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0732018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4065  thiamineS protein  31.91 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  36.92 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5653  thiamineS protein  37.5 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.764177  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0970  thiamineS  29.79 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1845  thiamineS protein  34.07 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0867  thiamine S  36.46 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  40.86 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  34.57 
 
 
91 aa  52  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1847  thiamineS protein  41.49 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0947  MoaD family protein  30.86 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.092475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  36.17 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0338  MoaD family protein  32.98 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000126888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0744  thiamineS  32.22 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.822098  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0189  hypothetical protein  31.91 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356126  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13129  molybdenum cofactor biosynthesis protein D moaD1  32.98 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139551 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1338  MoaD family protein  32.05 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  34.25 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  42.11 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  42.11 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3834  thiamineS protein  29.79 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  53.85 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  40.79 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  32.84 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1862  MoaD family protein  27.85 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>