36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2222 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2222  thiamineS  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1725  thiamineS protein  97.75 
 
 
89 aa  173  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1652  thiamineS protein  96.63 
 
 
89 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3526  thiamineS  71.88 
 
 
98 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3521  hypothetical protein  56.18 
 
 
89 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4464  thiamineS  53.93 
 
 
89 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591183  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4637  hypothetical protein  55.06 
 
 
89 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0945048  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2441  thiamineS protein  51.69 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_003296  RS05664  hypothetical protein  53.93 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04773  hypothetical protein  53.93 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4562  thiamineS protein  50.56 
 
 
89 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3490  thiamineS protein  49.44 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.374121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5087  thiamineS protein  49.44 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0464  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5115  hypothetical protein  46.07 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5164  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3203  hypothetical protein  44.94 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46760  hypothetical protein  57.3 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263835  decreased coverage  0.000000122547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4028  hypothetical protein  55.06 
 
 
89 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3392  thiamineS  46.07 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2284  hypothetical protein  48.31 
 
 
89 aa  69.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3051  thiamineS protein  39.77 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40 
 
 
480 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1679  thiamineS protein  32.39 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.658452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2823  thiamineS protein  35.21 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426705  normal  0.0485279 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3834  thiamineS protein  34.33 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  37.14 
 
 
643 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4204  thiamineS protein  31.11 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.975285  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4875  thiamineS protein  40.79 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1650  thiamineS protein  39.39 
 
 
90 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1820  hypothetical protein  31.25 
 
 
85 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.86 
 
 
364 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4986  thiamineS  28.41 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5013  thiamineS protein  25.33 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8124  thiamineS protein  32.1 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1165  MoaD family protein  30.53 
 
 
92 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.732653  hitchhiker  0.00571449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>