More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3854 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  70.45 
 
 
718 aa  960    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  67.84 
 
 
734 aa  857    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
747 aa  1448    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.95 
 
 
639 aa  402  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  38.15 
 
 
630 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  36.03 
 
 
792 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  38.52 
 
 
797 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
798 aa  389  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0489  heavy metal translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
751 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  37.99 
 
 
767 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  42.15 
 
 
752 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 
639 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.87 
 
 
818 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
643 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  36.24 
 
 
815 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  40.5 
 
 
656 aa  361  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
716 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
818 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  35.91 
 
 
743 aa  358  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  39.23 
 
 
628 aa  357  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.26 
 
 
889 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.44 
 
 
796 aa  357  5e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.29 
 
 
894 aa  357  5e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
971 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
828 aa  355  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
821 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.26 
 
 
889 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 
670 aa  355  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
793 aa  354  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  36.62 
 
 
805 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  37.12 
 
 
783 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  35.35 
 
 
828 aa  352  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
698 aa  349  8e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  40.48 
 
 
667 aa  349  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  39.43 
 
 
801 aa  349  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
828 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.76 
 
 
751 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.02 
 
 
623 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2964  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
753 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  41.01 
 
 
811 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
798 aa  348  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  38.37 
 
 
645 aa  348  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
798 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
637 aa  347  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1366  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
622 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  40.14 
 
 
973 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  35.36 
 
 
699 aa  346  8e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  38.61 
 
 
737 aa  346  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
797 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  38.85 
 
 
713 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
693 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  40.69 
 
 
804 aa  345  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 
639 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  36.47 
 
 
620 aa  344  2.9999999999999997e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  38.45 
 
 
823 aa  344  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  36.25 
 
 
806 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  32.92 
 
 
758 aa  342  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  37.26 
 
 
857 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.16 
 
 
785 aa  342  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  38.35 
 
 
803 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  36.08 
 
 
806 aa  342  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.5 
 
 
799 aa  342  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  37.24 
 
 
635 aa  342  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  39.6 
 
 
827 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  35.92 
 
 
805 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  35.92 
 
 
805 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.74 
 
 
814 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  35.92 
 
 
805 aa  341  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  34.19 
 
 
926 aa  340  4e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
833 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  40.69 
 
 
895 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  37.66 
 
 
742 aa  340  5e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  39.36 
 
 
715 aa  340  7e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  35.76 
 
 
805 aa  340  8e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  35.57 
 
 
804 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
795 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  35.42 
 
 
805 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  34.86 
 
 
760 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
867 aa  338  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  35.42 
 
 
805 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.52 
 
 
787 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  38.95 
 
 
679 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
835 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  39.46 
 
 
755 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 
738 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.77 
 
 
794 aa  337  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  33.52 
 
 
699 aa  337  5.999999999999999e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1098  copper-translocating P-type ATPase  40.55 
 
 
806 aa  336  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0763477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  33.57 
 
 
703 aa  336  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 
817 aa  336  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 
817 aa  336  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
809 aa  336  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
904 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  32.77 
 
 
710 aa  334  4e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  40.49 
 
 
646 aa  334  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 
794 aa  333  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.86 
 
 
817 aa  333  6e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
802 aa  333  7.000000000000001e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  35.97 
 
 
724 aa  333  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>