More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1366 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1366  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
622 aa  1252    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  71.7 
 
 
623 aa  889    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0093  heavy metal translocating P-type ATPase  49.51 
 
 
619 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  46.04 
 
 
625 aa  550  1e-155  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2304  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 
686 aa  515  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21740  heavy metal translocating P-type ATPase  43 
 
 
631 aa  477  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000439315  normal  0.410793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  40.07 
 
 
630 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  37.54 
 
 
783 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  40.86 
 
 
713 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  41.37 
 
 
815 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
743 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
737 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
802 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
802 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
798 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  38.65 
 
 
817 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
818 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
712 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.7 
 
 
709 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  36.34 
 
 
797 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.86 
 
 
712 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  39.78 
 
 
889 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40.14 
 
 
889 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 
712 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.59 
 
 
794 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 
866 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
894 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.19 
 
 
797 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.21 
 
 
796 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
836 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  34.19 
 
 
645 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  34.67 
 
 
792 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
821 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  35.68 
 
 
699 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
1022 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
755 aa  365  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  34.07 
 
 
707 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
823 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  36.1 
 
 
984 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 
734 aa  362  8e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  36.1 
 
 
984 aa  362  8e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 
637 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2544  heavy metal translocating P-type ATPase  37.41 
 
 
787 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.874956  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  36.93 
 
 
799 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  36.4 
 
 
815 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  35.99 
 
 
833 aa  361  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 
786 aa  362  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
817 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
817 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  34.51 
 
 
713 aa  361  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
815 aa  361  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
815 aa  361  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  38.2 
 
 
803 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
747 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  35.55 
 
 
751 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  34.14 
 
 
735 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.43 
 
 
814 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  37.04 
 
 
735 aa  357  5e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
785 aa  357  5e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
825 aa  357  5e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
836 aa  355  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  36.82 
 
 
715 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
753 aa  355  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  33.04 
 
 
767 aa  355  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.24 
 
 
885 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  33.28 
 
 
639 aa  354  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
798 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  37.77 
 
 
801 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  36.38 
 
 
773 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
798 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  36.83 
 
 
767 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.14 
 
 
905 aa  353  4e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  35.84 
 
 
656 aa  353  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  37.11 
 
 
804 aa  352  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
724 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  37.11 
 
 
809 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  35.64 
 
 
711 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
747 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  36.62 
 
 
804 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 
795 aa  352  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  36.04 
 
 
750 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  36.72 
 
 
743 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  39.3 
 
 
755 aa  352  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 
846 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  32.01 
 
 
868 aa  350  3e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  32.09 
 
 
675 aa  351  3e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  37.15 
 
 
793 aa  350  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  35.7 
 
 
800 aa  350  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  35.7 
 
 
800 aa  350  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
781 aa  350  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
781 aa  350  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
839 aa  350  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  35.24 
 
 
750 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  34.67 
 
 
758 aa  350  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  36.15 
 
 
849 aa  349  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 
637 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  36.87 
 
 
822 aa  349  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  38.93 
 
 
831 aa  349  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  36.55 
 
 
735 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>