More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1801 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
639 aa  1197    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  56.83 
 
 
639 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  53.45 
 
 
679 aa  569  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  53.43 
 
 
639 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  55.33 
 
 
656 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  56.12 
 
 
667 aa  544  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  53.39 
 
 
628 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  55.81 
 
 
646 aa  491  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  47.05 
 
 
643 aa  488  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  41.24 
 
 
634 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  41.01 
 
 
783 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1042  cation transport ATPase  39.09 
 
 
620 aa  433  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0059101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  44.08 
 
 
707 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A03  cation transport ATPase  37.96 
 
 
616 aa  432  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
712 aa  428  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 
712 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
712 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  44.61 
 
 
800 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  41.52 
 
 
767 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  44.61 
 
 
800 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  42.64 
 
 
735 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  40.56 
 
 
635 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  42.14 
 
 
751 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  38.86 
 
 
833 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
713 aa  415  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0981  cation transport ATPase  37.44 
 
 
633 aa  415  1e-114  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
791 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 
785 aa  409  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.96 
 
 
709 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
984 aa  409  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  41.86 
 
 
984 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 
939 aa  409  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.83 
 
 
739 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
812 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  44.8 
 
 
712 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  43.16 
 
 
799 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  42.83 
 
 
800 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  42.79 
 
 
651 aa  401  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  42.01 
 
 
673 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 
825 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
800 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
800 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  43.81 
 
 
744 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
737 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  39.28 
 
 
752 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  43.23 
 
 
750 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
750 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  41.98 
 
 
799 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  41.47 
 
 
675 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
750 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  41.35 
 
 
800 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  41.97 
 
 
724 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
723 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  42.57 
 
 
738 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  40.65 
 
 
885 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  38.51 
 
 
630 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
750 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
752 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  40 
 
 
769 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  42.95 
 
 
812 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  43.94 
 
 
793 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
750 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
798 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
726 aa  385  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  41.09 
 
 
972 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  37.02 
 
 
711 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  42.95 
 
 
904 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
748 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  39.74 
 
 
797 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  39.81 
 
 
748 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  41.06 
 
 
742 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  40.86 
 
 
868 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  39.72 
 
 
678 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  41.34 
 
 
734 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  42.95 
 
 
753 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
740 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  39.1 
 
 
850 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
726 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
743 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
654 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5411  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
660 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.043648 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  43.27 
 
 
740 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5391  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
660 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  41.28 
 
 
709 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
738 aa  379  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  41.59 
 
 
757 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0505  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
660 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
734 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  40.52 
 
 
851 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
718 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
637 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  36.45 
 
 
713 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  38.09 
 
 
815 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
768 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
656 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
1022 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  39.82 
 
 
926 aa  375  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  41 
 
 
801 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
677 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
701 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>