More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0186 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
670 aa  1324    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  55.92 
 
 
699 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2464  heavy metal translocating P-type ATPase  55.19 
 
 
689 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.301674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
630 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  38.61 
 
 
743 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
815 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.67 
 
 
821 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  39.42 
 
 
713 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
804 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  41.25 
 
 
817 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
817 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
817 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
797 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  37.58 
 
 
799 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  38.97 
 
 
783 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.69 
 
 
818 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.29 
 
 
814 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  40.3 
 
 
792 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
643 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
707 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
939 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
798 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.79 
 
 
709 aa  387  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.01 
 
 
767 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
803 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  38.74 
 
 
885 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  38.07 
 
 
712 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 
804 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  38.17 
 
 
797 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.06 
 
 
794 aa  381  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  39.03 
 
 
837 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.63 
 
 
805 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
712 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.66 
 
 
753 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  41.4 
 
 
740 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
796 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
857 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  43.32 
 
 
639 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
802 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
802 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
755 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
740 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
712 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  38.95 
 
 
801 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 
750 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  37.61 
 
 
751 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1533  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
724 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
823 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2304  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
686 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
833 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  37.4 
 
 
735 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
748 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
750 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.55 
 
 
752 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  36.87 
 
 
735 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 
825 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
750 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
894 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 
800 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
747 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  36.48 
 
 
822 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  40.44 
 
 
800 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  42.08 
 
 
942 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0093  heavy metal translocating P-type ATPase  39.35 
 
 
619 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
623 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  39.25 
 
 
750 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  37.87 
 
 
718 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
799 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  35.6 
 
 
758 aa  374  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  37.34 
 
 
851 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  42.46 
 
 
792 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  37.19 
 
 
736 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  36.42 
 
 
752 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.91 
 
 
628 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  40.13 
 
 
734 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
781 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  36.47 
 
 
781 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  37.1 
 
 
804 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  37.12 
 
 
787 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
984 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
984 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
836 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  39.8 
 
 
738 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  39.93 
 
 
809 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  40.07 
 
 
673 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
836 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  41.88 
 
 
742 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
795 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  35.87 
 
 
798 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.88 
 
 
805 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  36.39 
 
 
805 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  36.39 
 
 
805 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
828 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
806 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
800 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.88 
 
 
805 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  36.39 
 
 
805 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  35.87 
 
 
798 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  38.94 
 
 
737 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
800 aa  369  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>