More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0060 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  71.53 
 
 
971 aa  818    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  53.98 
 
 
718 aa  698    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
752 aa  1472    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  44.09 
 
 
695 aa  588  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  52.11 
 
 
693 aa  571  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 
698 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  49.16 
 
 
710 aa  533  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  46.46 
 
 
699 aa  530  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
702 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  48.88 
 
 
693 aa  510  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  41.85 
 
 
691 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  44.18 
 
 
722 aa  495  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  40.71 
 
 
716 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
701 aa  432  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  38.47 
 
 
691 aa  426  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  43.72 
 
 
719 aa  423  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  38.63 
 
 
691 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  43.98 
 
 
698 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
698 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  41.99 
 
 
718 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  35.92 
 
 
691 aa  382  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  34.92 
 
 
696 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  40.36 
 
 
718 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 
747 aa  369  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  38.53 
 
 
712 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
731 aa  356  8.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  43.17 
 
 
734 aa  355  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  39.4 
 
 
700 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
702 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  35.91 
 
 
630 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  32.67 
 
 
755 aa  337  7e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  33.6 
 
 
818 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.23 
 
 
797 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.42 
 
 
798 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0133  copper-translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
793 aa  325  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489704  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  35.17 
 
 
707 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 
836 aa  322  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  37 
 
 
837 aa  322  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  37.36 
 
 
703 aa  320  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.47 
 
 
770 aa  319  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 
826 aa  317  4e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.86 
 
 
798 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.86 
 
 
798 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  31.98 
 
 
783 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0489  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 
751 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  35.97 
 
 
787 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 
795 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  37.46 
 
 
670 aa  306  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  35.69 
 
 
822 aa  306  8.000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  32.55 
 
 
712 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 
852 aa  306  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  35.16 
 
 
818 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  32.58 
 
 
857 aa  306  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.18 
 
 
838 aa  306  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  33.02 
 
 
743 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  32.38 
 
 
712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
773 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  34.64 
 
 
743 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  35.05 
 
 
736 aa  305  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  34.82 
 
 
976 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  33.51 
 
 
835 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  29.95 
 
 
737 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
823 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  32.38 
 
 
712 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  38.22 
 
 
821 aa  303  6.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  34.66 
 
 
801 aa  303  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 
846 aa  303  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
816 aa  303  9e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
855 aa  303  9e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.9 
 
 
821 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  33.96 
 
 
804 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
833 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
833 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  32.94 
 
 
767 aa  302  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  38.02 
 
 
806 aa  301  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.27 
 
 
628 aa  301  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.13 
 
 
833 aa  301  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
755 aa  300  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  36.55 
 
 
839 aa  300  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  36.48 
 
 
834 aa  300  7e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  37.16 
 
 
815 aa  298  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  37.16 
 
 
815 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.84 
 
 
797 aa  299  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  34.72 
 
 
737 aa  298  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.1 
 
 
805 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  32.96 
 
 
815 aa  298  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
781 aa  298  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2575  heavy metal translocating P-type ATPase  38.11 
 
 
857 aa  298  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
781 aa  298  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  34.91 
 
 
895 aa  298  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
637 aa  297  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  31.36 
 
 
677 aa  297  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  39.63 
 
 
646 aa  297  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1233  hypothetical protein  34.87 
 
 
810 aa  296  7e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  35.35 
 
 
816 aa  296  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  36.13 
 
 
767 aa  296  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  37.4 
 
 
786 aa  296  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  35.2 
 
 
834 aa  296  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 
811 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  34.59 
 
 
817 aa  296  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>