More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0489 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0489  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
751 aa  1506    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  37.67 
 
 
718 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  38.3 
 
 
747 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  39.21 
 
 
734 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
752 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  30.95 
 
 
812 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  30.6 
 
 
825 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0186  heavy metal translocating P-type ATPase  36.08 
 
 
670 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  33.22 
 
 
630 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  33.45 
 
 
783 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 
639 aa  317  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  36.89 
 
 
805 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  36.89 
 
 
805 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  36.89 
 
 
805 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  36.89 
 
 
805 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  36.7 
 
 
805 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  36.7 
 
 
806 aa  312  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  34.47 
 
 
868 aa  312  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  36.52 
 
 
805 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 
806 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  36.7 
 
 
805 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  30.84 
 
 
833 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  29.21 
 
 
702 aa  310  6.999999999999999e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  37.24 
 
 
716 aa  309  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  34.01 
 
 
785 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
797 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.33 
 
 
806 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  34.37 
 
 
637 aa  307  6e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  38.99 
 
 
792 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
693 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  32.54 
 
 
798 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  37.75 
 
 
804 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  34.1 
 
 
926 aa  304  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 
712 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 
712 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
810 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  33.96 
 
 
821 aa  297  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  34.01 
 
 
850 aa  297  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  31.48 
 
 
703 aa  296  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  30.6 
 
 
712 aa  296  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  34.1 
 
 
701 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  35.08 
 
 
797 aa  296  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  33.16 
 
 
645 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  33.44 
 
 
737 aa  295  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  35.64 
 
 
828 aa  295  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
905 aa  294  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1801  heavy metal translocating P-type ATPase  37.35 
 
 
639 aa  294  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0762097  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  28.39 
 
 
698 aa  294  5e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  33.8 
 
 
803 aa  294  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
936 aa  294  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  32.82 
 
 
713 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.11 
 
 
796 aa  293  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  32.34 
 
 
767 aa  292  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.07 
 
 
798 aa  292  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.07 
 
 
798 aa  292  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  34.11 
 
 
817 aa  292  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  34.77 
 
 
820 aa  291  2e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  33.16 
 
 
707 aa  291  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  32.75 
 
 
851 aa  291  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  36.28 
 
 
628 aa  291  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  34.11 
 
 
828 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  32.19 
 
 
799 aa  290  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
818 aa  289  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
812 aa  289  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  33.44 
 
 
743 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  32.94 
 
 
701 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
790 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  34.56 
 
 
841 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  39.05 
 
 
741 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 
679 aa  287  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
786 aa  287  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
889 aa  286  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  36.9 
 
 
718 aa  286  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  32.78 
 
 
719 aa  286  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  33.33 
 
 
828 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1777  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 
814 aa  286  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0428003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  35.6 
 
 
639 aa  285  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
971 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
813 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  38.58 
 
 
824 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  32.91 
 
 
1022 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  33.64 
 
 
818 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0713  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
872 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0185288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  35.19 
 
 
799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.09 
 
 
794 aa  285  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  34.67 
 
 
738 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
740 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 
838 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  38.36 
 
 
748 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  35.34 
 
 
742 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  33.11 
 
 
709 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  37.41 
 
 
821 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 
718 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
748 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2453  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
765 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0125  putative copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
813 aa  283  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  33.92 
 
 
841 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  34.14 
 
 
752 aa  283  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
656 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
786 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>