More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0473 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0473  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
699 aa  1412    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1417  heavy metal translocating P-type ATPase  47.71 
 
 
971 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06700  heavy metal translocating P-type ATPase  40.11 
 
 
702 aa  536  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000434785  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1944  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
695 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1346  heavy metal translocating P-type ATPase  41.08 
 
 
693 aa  525  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000243263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12940  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 
710 aa  520  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.793876  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1098  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 
693 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000158544  hitchhiker  0.0000000000000761512 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1083  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
698 aa  516  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0265246  hitchhiker  0.000000000000296825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0060  heavy metal translocating P-type ATPase  46.53 
 
 
752 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  41.12 
 
 
691 aa  500  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.205705  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0966  heavy metal translocating P-type ATPase  37.95 
 
 
722 aa  476  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000592542  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1752  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
718 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00181407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0495  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
716 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22710  heavy metal translocating P-type ATPase protein  36.83 
 
 
719 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1389  tetrapyrrole methylase family protein  35.26 
 
 
691 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.512552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2577  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 
698 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0984175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3193  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
701 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1377  heavy metal translocating P-type ATPase subfamily protein  34.29 
 
 
691 aa  395  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0831  metal transporting atpase Mta72  40.11 
 
 
691 aa  391  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0130757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3620  heavy metal translocating P-type ATPase  34.65 
 
 
731 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0353  metal transporting atpase Mta72  34.58 
 
 
696 aa  348  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.699181  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2796  heavy metal translocatin P-type ATPase  36.2 
 
 
718 aa  347  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0714  heavy metal translocating P-type ATPase  31.81 
 
 
698 aa  340  4e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.673424  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2905  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 
712 aa  332  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.850846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2820  heavy metal translocating P-type ATPase  32.74 
 
 
872 aa  332  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3854  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000610178  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1344  heavy metal translocating P-type ATPase  33.08 
 
 
702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1568  putative cation transport ATPase  32.37 
 
 
703 aa  326  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.349001  normal  0.0140586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13299  metal cation transporter P-type ATPase C ctpC  32 
 
 
718 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.685827  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2844  heavy metal translocating P-type ATPase  30.38 
 
 
872 aa  317  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.122153 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6437  heavy metal translocating P-type ATPase  30.17 
 
 
817 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
734 aa  307  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106474  normal  0.0243366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0992  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  29.81 
 
 
737 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519582  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3361  heavy metal translocating P-type ATPase  30.56 
 
 
755 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  32.95 
 
 
630 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0220  heavy metal translocating P-type ATPase  29.78 
 
 
743 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1911  heavy metal translocating P-type ATPase  34.53 
 
 
839 aa  300  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0498  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
700 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  32.31 
 
 
639 aa  289  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
639 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  31.19 
 
 
812 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0343  cadmium efflux ATPase  35.32 
 
 
645 aa  287  5e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5064  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.76 
 
 
770 aa  286  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217431  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  31.97 
 
 
712 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
712 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
712 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  31.68 
 
 
805 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3584  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 
723 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.278523 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  32.97 
 
 
635 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
822 aa  277  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  31.33 
 
 
806 aa  276  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  31.38 
 
 
625 aa  276  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
806 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  31.64 
 
 
628 aa  274  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.21 
 
 
709 aa  273  6e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  31.02 
 
 
707 aa  273  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2999  heavy metal translocating P-type ATPase  27.54 
 
 
805 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000764735  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  31.15 
 
 
805 aa  272  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  32.17 
 
 
767 aa  272  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1662  heavy metal translocating P-type ATPase  32.99 
 
 
656 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  30.97 
 
 
805 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2543  heavy metal translocating P-type ATPase  30.79 
 
 
623 aa  271  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452122 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0348  cation transport ATPase  30.69 
 
 
634 aa  271  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00293849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  33.58 
 
 
713 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  30.97 
 
 
805 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  28.93 
 
 
797 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  35.01 
 
 
1022 aa  269  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1097  copper exporting ATPase  35.46 
 
 
907 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  31.46 
 
 
793 aa  269  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  32.18 
 
 
783 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3220  copper exporting ATPase  35.56 
 
 
907 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  31.67 
 
 
826 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
647 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  30.78 
 
 
805 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6196  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.13 
 
 
814 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  30.78 
 
 
805 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  31.03 
 
 
857 aa  268  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
640 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  30.33 
 
 
836 aa  268  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  30.97 
 
 
806 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  30.78 
 
 
805 aa  267  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.21 
 
 
641 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 
823 aa  267  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  30.6 
 
 
851 aa  267  5.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  31.19 
 
 
833 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.3 
 
 
821 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3027  copper exporting ATPase  34.83 
 
 
955 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  29.02 
 
 
740 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  27.97 
 
 
738 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2304  heavy metal translocating P-type ATPase  30.65 
 
 
686 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  32.25 
 
 
641 aa  265  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  32.16 
 
 
679 aa  264  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  29.78 
 
 
677 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  32.25 
 
 
641 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3165  copper exporting ATPase  35.04 
 
 
961 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.517155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.06 
 
 
751 aa  263  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  32.1 
 
 
797 aa  263  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  31.92 
 
 
976 aa  263  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.78 
 
 
737 aa  263  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1265  copper exporting ATPase  35.04 
 
 
955 aa  263  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.057349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>