71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2226 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 319 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185983  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8498  putative transmembrane protein  40.86 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.02 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1083  hypothetical protein  35.96 
 
 		 286 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00485485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.710636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.36317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  31.85 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  29.08 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  28.91 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  30.94 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.42 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.6 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.74 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  34.78 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  34.78 
 
 		 236 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  34.44 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  34.44 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  34.44 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  34.44 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.53 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.29 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.29 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.67 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.29 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  25.48 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.86 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.16 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.01 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  34.75 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  38.67 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  35.03 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.79 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.64 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.71 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.71 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.98 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.12 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  29.73 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  20.56 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  28.47 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  23.33 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.26 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.7 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.71 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  21.69 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.69 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 286 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.37 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  35.63 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  26.74 
 
 		 333 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.55 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.65 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 300 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.88 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  24.83 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  36.05 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>