115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1083 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1083  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00485485  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8498  putative transmembrane protein  52.59 
 
 
334 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.9 
 
 
322 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.57 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.36317  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 
319 aa  112  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185983  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.710636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  31.8 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  30.36 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.43 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.02 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.02 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  30.11 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.02 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  28.18 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.34 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.3 
 
 
289 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.17 
 
 
287 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  22.45 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  30.07 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  27.93 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  27.93 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  27.93 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.67 
 
 
302 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
286 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  30.04 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  22.45 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  21.91 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  21.91 
 
 
301 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  21.91 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.01 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.07 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.31 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  21.86 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.9 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  26.64 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  21.86 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  24.38 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  29.39 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.9 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.31 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  21.9 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.9 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  29.71 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.9 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  29.35 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  29.35 
 
 
331 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  20.35 
 
 
301 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  21.9 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.9 
 
 
303 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.95 
 
 
301 aa  52.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.2 
 
 
307 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  27.62 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  23.27 
 
 
301 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  22.6 
 
 
301 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  26.39 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  25.19 
 
 
341 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  21.63 
 
 
301 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  29.04 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  30.33 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  23.81 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  21.43 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  25.68 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  27.24 
 
 
395 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.53 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.27 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  35.71 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  27.93 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.27 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  27.31 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.91 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  27.24 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  30.28 
 
 
314 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  32.55 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  22.18 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.9 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.11 
 
 
301 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.9 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.9 
 
 
316 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
311 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.9 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  24.31 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  28.33 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.96 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  27.91 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  25.55 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>