57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1987 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1987  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 170 aa  336  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000389014  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  37.84 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  46.15 
 
 		 340 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  38.2 
 
 		 238 aa  51.6  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.48 
 
 		 246 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.48 
 
 		 246 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.92 
 
 		 245 aa  50.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.67 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  52.17 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  49.12 
 
 		 249 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.54 
 
 		 302 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  51.16 
 
 		 225 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  42.42 
 
 		 417 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  40 
 
 		 248 aa  47.4  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  45.21 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  45.9 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.36 
 
 		 241 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  44.44 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.11 
 
 		 236 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.54 
 
 		 270 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  43.1 
 
 		 259 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  46.43 
 
 		 274 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.13 
 
 		 244 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  57.14 
 
 		 243 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  43.1 
 
 		 264 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  53.33 
 
 		 254 aa  44.3  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.78 
 
 		 248 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.66 
 
 		 235 aa  44.3  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  46.67 
 
 		 246 aa  44.3  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  41.54 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  40.35 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.68 
 
 		 251 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  47.62 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0419  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.1 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.069314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  34.29 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.3 
 
 		 243 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  41.18 
 
 		 195 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  41.07 
 
 		 225 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  40.82 
 
 		 214 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.31 
 
 		 268 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.11 
 
 		 241 aa  41.6  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.5 
 
 		 256 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  38.89 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.84 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.07 
 
 		 194 aa  41.2  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.18 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.18 
 
 		 212 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.03 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.34 
 
 		 208 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.68 
 
 		 279 aa  40.8  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  46.51 
 
 		 249 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.84 
 
 		 242 aa  40.8  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  44 
 
 		 265 aa  40.8  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.58 
 
 		 214 aa  40.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>