More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0162 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
385 aa  724    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.42 
 
 
329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  45.48 
 
 
410 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.59 
 
 
426 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.15 
 
 
448 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.6 
 
 
410 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.7 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.7 
 
 
419 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.38 
 
 
405 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.17 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.56 
 
 
406 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
422 aa  236  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.34 
 
 
419 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02124  siroheme synthase  42.75 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.26 
 
 
398 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.26 
 
 
398 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.26 
 
 
398 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  39.84 
 
 
407 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.43 
 
 
411 aa  223  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1326  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.93 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0751578  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.43 
 
 
414 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  51.9 
 
 
276 aa  222  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.16 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  52.14 
 
 
513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.1 
 
 
475 aa  220  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  40.22 
 
 
405 aa  219  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.86 
 
 
491 aa  219  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.76 
 
 
507 aa  219  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2812  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.12 
 
 
420 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00743993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.43 
 
 
403 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.77 
 
 
416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3111  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.36 
 
 
418 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.58 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.5 
 
 
413 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3545  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.78 
 
 
417 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.44 
 
 
258 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
403 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  decreased coverage  0.000494849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.44 
 
 
258 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5854  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.27 
 
 
405 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.148412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.44 
 
 
258 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  45.3 
 
 
516 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.44 
 
 
258 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.81 
 
 
570 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
504 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.1 
 
 
245 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.86 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 
258 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
512 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.56 
 
 
447 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.22 
 
 
508 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.57 
 
 
512 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1175  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.26 
 
 
252 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0224859 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.6 
 
 
258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  45.15 
 
 
505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.12 
 
 
511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
504 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.76 
 
 
503 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2253  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.57 
 
 
266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  0.0491456 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
510 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.43 
 
 
508 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.38 
 
 
553 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  48.28 
 
 
513 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.06 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.33 
 
 
484 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.93 
 
 
497 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.58 
 
 
277 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
511 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.35 
 
 
507 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1682  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.92 
 
 
264 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.577733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  45.64 
 
 
513 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3559  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.64 
 
 
261 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.895893  normal  0.323938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  38.66 
 
 
479 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
261 aa  192  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  43.88 
 
 
473 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.17 
 
 
493 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.83 
 
 
272 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  43.88 
 
 
473 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  43.88 
 
 
470 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
250 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2013  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.38 
 
 
283 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 
259 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.85 
 
 
271 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.73 
 
 
505 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  56.12 
 
 
550 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
463 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.67 
 
 
511 aa  190  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
492 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.73 
 
 
463 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  47.84 
 
 
515 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.86 
 
 
506 aa  189  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.06 
 
 
497 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000345374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.66 
 
 
258 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1774  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
426 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.254822  normal  0.025791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.68 
 
 
275 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  41.11 
 
 
467 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0211  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.03 
 
 
239 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.283358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  48.82 
 
 
490 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>