More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5796 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5796  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
271 aa  515  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991425  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0796  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  81.05 
 
 
276 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.72 
 
 
512 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2221  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.56 
 
 
426 aa  248  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12862  multi-functional enzyme siroheme synthase cysG: uroporphyrin-III C-methyltransferase + precorrin-2 oxidase + ferrochelatase  56.02 
 
 
405 aa  248  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000225219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1323  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.96 
 
 
448 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2321  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.85 
 
 
405 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4047  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.56 
 
 
403 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.79 
 
 
504 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.23 
 
 
505 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2305  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.42 
 
 
402 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193462  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.94 
 
 
511 aa  238  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  48.56 
 
 
516 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2074  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.04 
 
 
398 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2120  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.04 
 
 
398 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0228819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2057  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  54.04 
 
 
398 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177628  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1744  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.77 
 
 
263 aa  235  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7364  siroheme synthase  50.62 
 
 
410 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0139888  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3920  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.55 
 
 
419 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.797973  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.96 
 
 
504 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1616  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.6 
 
 
475 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.512799  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  50.62 
 
 
505 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3863  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.89 
 
 
258 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.707668  hitchhiker  0.0000644403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1734  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.69 
 
 
406 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0333412  normal  0.124511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  54.39 
 
 
513 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1481  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17730  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.11 
 
 
329 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243259  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
258 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.31 
 
 
491 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
258 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  52.89 
 
 
520 aa  225  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.06 
 
 
258 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1349  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
258 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.758533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.64 
 
 
258 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
249 aa  222  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.61 
 
 
512 aa  222  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  50.42 
 
 
513 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.33 
 
 
511 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.91 
 
 
510 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1233  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.4 
 
 
254 aa  219  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.323489  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3431  uroporphyrin-III C-methyltransferase  60.52 
 
 
426 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.447049  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1724  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
250 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  48.16 
 
 
513 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0319  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.21 
 
 
497 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.09 
 
 
259 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
503 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6102  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.85 
 
 
570 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229547  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.95 
 
 
503 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2248  uroporphyrin-III C-methyltransferase  58.37 
 
 
416 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000210375  normal  0.280858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1703  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.89 
 
 
411 aa  216  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1148  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.57 
 
 
258 aa  215  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.660594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4663  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.93 
 
 
394 aa  215  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.607311  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2143  uroporphyrin-III C-methyltransferase  53.16 
 
 
413 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0536  uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.96 
 
 
419 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.865143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.87 
 
 
519 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1791  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.6 
 
 
255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.693099  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.19 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  55.93 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22640  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  56.54 
 
 
414 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
246 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.519237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1105  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  46.5 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000034343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.12 
 
 
503 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.15 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0581  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.14 
 
 
264 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2561  uroporphyrin-III C-methyltransferase  55.56 
 
 
410 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.945162  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0984  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.21 
 
 
245 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.084748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.9 
 
 
463 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0528  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  57.61 
 
 
508 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.216012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.37 
 
 
511 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.59 
 
 
480 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  51.87 
 
 
385 aa  208  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.9 
 
 
463 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  47.77 
 
 
464 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  49.37 
 
 
515 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  44.4 
 
 
259 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1023  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.47 
 
 
493 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.44 
 
 
507 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
464 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.34 
 
 
510 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.76 
 
 
480 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.08 
 
 
463 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1025  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.91 
 
 
293 aa  205  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2600  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  55.12 
 
 
407 aa  204  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.177036  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00850  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.42 
 
 
340 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.580236 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
479 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  47.74 
 
 
464 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.83 
 
 
508 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3676  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.37 
 
 
272 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0240  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.13 
 
 
242 aa  203  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2200  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.93 
 
 
261 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0396322  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10020  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  53.11 
 
 
422 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0127568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.4 
 
 
479 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.74 
 
 
546 aa  202  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  52.05 
 
 
271 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1712  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.49 
 
 
464 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5880  uroporphyrin-III C-methyltransferase  50.84 
 
 
492 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204086  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2131  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.02 
 
 
507 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0860734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>